提出疾病關聯分析應充分使用測序技術而非基因分型技術

10月4日，由深圳華大基因與加州大學伯克利分校、哥本哈根大學等單位合作的研究成果 “對200個人類外顯子的測序揭示大量低頻率非同義突變的存在”在國際著名學術雜誌《自然—遺傳學》（Nature Genetics）上發表。這是中外科學家在人類基因組研究領域取得的又一項重要成果。

該研究對200個丹麥個體蛋白質編碼基因的外顯子組進行了深度測序，發現了大量以往未知的單核苷酸多態性位點（SNP），其中大部分在人群中都以較低頻率出現。該研究完成了目前在人類外顯子區域規模最大、分辨率最精細的遺傳圖譜，並以翔實的數據證明，人群當中的低頻率多態性位點富集了大量能引起蛋白質氨基酸序列改變的變異，而這類變異在人群中受到自然選擇作用，可能具有影響人類健康的功能。

最近有多項科學研究指出，以往對多基因控製的複雜疾病所進行的關聯分析研究盡管從理論上可行，並在實踐中發現了許多疾病關聯基因，但卻僅能解釋複雜疾病遺傳性的一小部分。這一現象被稱為“遺傳度缺失”，是當前複雜疾病基因組研究的一個主要難題。此研究首次證實，影響人類健康和疾病易感性的多態性位點在人群中往往頻率低，但是相關位點的個數很多。既往的複雜疾病關聯分析使用的基因分型芯片僅對常見多態性位點進行測定，而無法研究低頻率多態性位點，從而漏掉大量疾病關聯位點，造成“遺傳度缺失”。該研究不僅指出了目前主流疾病研究方法的缺陷，並顛覆性地提出疾病關聯分析應充分使用測序技術而非基因分型技術，從而對改變科學家對複雜疾病的研究手段，推動人類健康與醫學研究的進步具有裏程碑意義。

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《自然—遺傳學》發表論文摘要（英文）