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《自然—遺傳學》:急性單核細胞性白血病與DNA甲基轉移酶有關
來自上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院上海血液學研究所/醫學基因組學國家重點實驗室,中國醫科大學附屬第一醫院和上海交通大學係統生物醫學研究院的科學家們在最新一期的《自然—遺傳學》(Nature Genetics)雜誌上發表了白血病研究新進展文章“Exome sequencing identifies somatic mutations of DNA methyltransferase gene DNMT3A in acute monocytic leukemia”。
文章通訊作者是來自上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院上海血液學研究所/醫學基因組學國家重點實驗室的陳竺院士和陳賽娟院士。
表觀遺傳修飾(epigenetic modification)是指基於非基因序列改變所致基因表達水平變化,如DNA甲基化、組蛋白乙酰化和甲基化、RNA相關性沉默等。近年來大量的研究表明表觀遺傳學改變與細胞的生長、分化、凋亡、轉化及腫瘤進展相關基因的轉錄密切相關,在腫瘤的發生過程中扮演著重要的角色。
急性白血病是造血係統的惡性腫瘤,特點為造血細胞的某一係列在骨髓中惡性增生,並進入血流浸潤各組織器官,引起一係列臨床表現。其中小兒白血病是小兒發病率最高的惡性腫瘤,最常見的類型為急性淋巴細胞白血病(Acute Lymphoblastic Leukemia,ALL),占所有小兒急性白血病的80%。而急性髓係白血病(acute myeloid leukemia,AML)是成人中最常見的急性白血病。
盡管近年來一些研究發現抑癌基因甲基化在急性白血病中普遍存在,然而由於常規的全基因組測序技術存在著工作量大、耗時長、成本高等局限,使得目前隻有少數基因的甲基化狀態被確定與患者的臨床特征即預後有關。外顯子組(exome)測序是一種新型的基因組分析技術。由於外顯子組僅占人類基因組的百分之一。測定外顯子序列隻需針對外顯子區域的DNA即可,因此遠比進行全基因組序列測序更簡便、經濟,開始被廣泛應用到遺傳病的相關研究中。
在這篇文章中,研究人員利用先進的外顯子組測序技術對急性髓係白血病M5型(又稱急性單核細胞性白血病,AML-M5)的患者血液樣品進行了篩查,發現112名患者中有23例存在著DNA甲基轉移酶基因DNMT3A突變,比例為20.5%。DNMT3A突變體功能分析結果顯示酶活性減少,與組蛋白H3親和力下降。在進一步的研究中,研究人員證實DNMT3A突變樣品中的DNA甲基化模式和基因表達均發生了顯著改變。DNMT3A突變與急性白血病高發病率及預後不良有著密切的關係。此外研究人員還在篩查其他白血病亞型時發現13.6%的急性髓係白血病M4型的患者Arg882發生了改變。
新研究發現證實了異常的DNA甲基化轉移酶活性與急性單核細胞性白血病發病密切相關,並為疾病的診斷和預後評價提供了一個有潛力的生物標記。(來源:生物通 何嬙)
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