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科技日報:國內首個乙肝病毒基因多功能共享數據庫建成
近日,國內首個乙型肝炎病毒基因多功能共享數據庫在解放軍302醫院建成並投入使用,其收錄了我國10000餘例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相關臨床資料,具有較強的生物信息學分析功能,為研究我國患者乙型肝炎病毒基因變異與耐藥、分子致病機製、疫苗設計和免疫應答等提供了共享信息平台,也可為臨床合理製訂抗病毒治療方案提供幫助。
據全軍傳染病研究所副所長、解放軍302醫院徐東平研究員介紹,這個數據庫具有序列數據量大、數據資源免費共享的特點,並可係統地檢測和監控核苷(酸)類抗病毒藥物耐藥變異;此外,該數據庫還在不斷收錄新的病例資料和序列信息,具有可擴充性。該數據庫目前已收錄了2000多個代表性病毒基因克隆,收錄了耐藥變異、抗病毒藥物治療和臨床應答指標等相關信息。
數據庫具有多種實用生物信息學分析功能,包括序列相似性比對、基因亞型分析、HBV血清型分析、核苷類似物耐藥位點分析、特異性T淋巴細胞表位分析、病毒基因組係統進化樹分析以及個性化數據篩選分析功能,能從核酸和蛋白兩個層次,對HBV各個功能區不同長度的序列多態性進行統計。數據庫已在多家醫療與科研單位進行了應用,取得了預期效果,目前已正式聯網運行。
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2011/5/246823.shtm