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專家人才

  • 姓名:趙永兵
  • 性別:
  • 職稱:研究員
  • 學曆:博士
  • 電話:
  • 傳真:
  • 電子郵件:zhao_yongbing@gibh.ac.cn
  • 通訊地址廣州市黃埔區開源大道190號

    簡曆:

  • 202310至今betway体育下载 研究員

    201702202310月美國國立衛生研究院(NIH) /博士後(Postdoctoral Fellow)、專職研究員(Research Fellow)

    201410201702月梅奧醫學中心(Mayo Clinic)/專職研究員(Research Fellow)

    200908201407月中國科學院北京基因組研究所/博士

    200509200906月華中科技大學/學士

    研究領域:

  • 課題組主要研究細胞命運決定過程中的基因轉錄調控規則和機製。具體研究內容包括:

    1)構建和應用深度學習模型、開發組學數據分析方法;

    2)研究基因組調控區域的序列特征、啟動子與增強子間的相互作用規則、轉錄因子間合作規則,及它們對基因轉錄的影響;

    3)探索細胞特異性調控網絡及其在細胞發育、分化和疾病發生中的分子機製。

    為實現這些研究內容,課題組將采用多學科的方法和技術,包括深度學習、生物信息學、基因組學、CRISPR基因編輯、高通量篩選、以及各種測序技術(STARR-SeqHi-CATAC-SeqChIP-SeqRNA-Seq)

    更多信息請訪問:https://www.zhaopage.com

    承擔科研項目情況:

    社會任職:

    獲獎及榮譽:

    代表論著:

  • 說明:#為共同第一作者,*為通訊作者

    1.Yongbing Zhao#*. TFSyntax: a database of transcription factors binding syntax in mammalian genomes. Nucleic Acids Research, 2023

    2.Yongbing Zhao#*, Supriya V. Vartak#, Andrea Conte#, Xiang Wang#, David A. Garcia#, Evan Stevens, Seol Kyoung Jung, Kyong-Rim Kieffer-Kwon, Laura Vian, Timothy Stodola, Francisco Moris, Laura Chopp, Silvia Preite, Pamela L. Schwartzberg, Joseph M. Kulinski, Ana Olivera, Christelle Harly, Avinash Bhandoola, Elisabeth F. Heuston, David M. Bodine, Raul Urrutia, Arpita Upadhyaya, Matthew T. Weirauch, Gordon Hager and Rafael Casellas*. "Stripe" transcription factors provide accessibility to co-binding partners in mammalian genomes. Molecular Cell, 2022

    3.Yongbing Zhao*, Jinfeng Shao, Yan W Asmann*. Assessment and Optimization of the Interpretability of Machine Learning Models Applied to Transcriptomic Data. Genomics, Proteomics and Bioinformatics, 2022

    4.Yongbing Zhao#, Jinyue Wang#, Fang Liang, Yanxia Liu, Qi Wang, Hao Zhang, Meiye Jiang, Zhewen Zhang, Wenming Zhao, Yiming Bao, Zhang Zhang, Jiayan Wu, Yan W Asmann, Rujiao Li, Jingfa Xiao. NucMap: a database of genome-wide nucleosome positioning map across species. Nucleic Acids Research, 2019

    5.Gaihua Zhang#,Yongbing Zhao#, Yi Liu#, Lipin Kao, Xiao Wang, Benjamin Skerry, and Zhaoyu Li. FOXA1 Defines Cancer Cell Specificity. Science Advances, 2016

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