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【廣東科技報】廣州生物院開發RICK技術成功分離RNA結合蛋白
本報訊 北京時間2月13日零點,betway体育下载 在Nature Methods(《自然-方法學》)雜誌在線發表了分離RNA結合蛋白的新技術,該技術是全麵分析細胞內的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助於揭開基因組中的”暗物質“-非編碼RNA的未知功能。
有數以百計的蛋白質可以與RNA結合,其中很多涉及神經退行性病變、自身免疫缺陷和癌症等疾病。那麼,如何係統地分離RNA結合蛋白的問題變得引人注目。前期科學家們係統地分離了細胞內mRNA結合蛋白,這隻是眾多轉錄本中的一部分,細胞還包含了很多非polyA RNA。
廣州生物院的Miguel A. Esteban、張必良和鮑習琛領銜的科研團隊設計了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技術,利用核酸標記技術,巧妙地將新合成的RNA標記上生物素,通過鏈黴親和素偶聯的磁珠,分離得到相應被標記RNA分子和與其相結合的蛋白分子。
通過這一技術,研究人員係統地分離了包括非polyA尾RNA和新生RNA在內的一係列RNA分子及其結合蛋白。進一步地分析發現,細胞分裂調控因子作為新的RNA結合蛋白,存在結合非polyA尾RNA的潛能。研究人員縮短標記的時間,成功地在細胞中分離了新生RNA結合蛋白。這些蛋白與新生RNA的轉錄及後續的加工、剪切等調控密切相關。這一技術的應用將有助於深入地剖析RNA結合蛋白的作用機製,也是細胞命運轉變過程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。
研究工作獲得國家重點研發計劃項目、國家自然科學基金委、廣州珠江科技新星、中科院青年創新促進會等項目的資助。