4月27日，華中農業大學農業微生物國家重點實驗室曹罡教授應邀到betway体育下载 做學術報告交流。報告圍繞Development and Application of Biomacromolecule Spatial-Omics，介紹了曹罡教授實驗室開發的多種空間測序技術。本次報告由彭廣敦研究員主持。

　　曹罡教授從DNA、RNA、蛋白質的空間測序以及空間整合connectome四個方麵展開報告。在DNA空間測序的報告內容中，曹罡教授團隊不僅發現在從單核細胞-巨噬細胞-M1型巨噬細胞轉化過程中的細胞核形態變化，同時發現在細胞類型轉化過程中三維基因組的互作變化，得出在細胞的分化過程中或許伴隨著基因共表達係數TAD的降低過程。此外，通過三維基因組學的分析方法，發現了DNA病毒在入侵細胞基因組時，NF-kB在介導病毒DNA入侵宿主細胞過程中的作用，並經過進一步的探索，找到可抑製其作用的維生素藥物。

　　在RNA空間轉錄組測序部分，曹罡老師的技術原理不同於當前基於二代測序的技術，而是在原位進行轉錄組擴增的同時結合原位成像基數，從而實現組織的原位的轉錄組測序。稱為SSIP-seq的原位轉錄組測序技術，結合pair-end的測序方式，不僅可以實現高達20%的轉錄組捕獲率，還可以實現亞細胞的分辨率、檢測到轉錄本上的堿基突變。

　　當談到蛋白質的空間測序時，不同於傳統的多輪抗原-抗體組合方式，曹罡教授的團隊在抗體的末端連接了一段寡核苷酸，將蛋白的檢測轉化為對核酸的檢測，從而實現對空間蛋白互作的解析，該方法比傳統的蛋白檢測方法靈敏度可高達100倍。同時，曹教授開發的Pai-FISH方式，也有趕超RNAscope的勢頭。

　　最後，結合曹罡教授的神經生物學以及神經病原學的生物學背景，設計病毒攜帶不同的barcode片段，而後將病毒注射到腦內核團，利用病毒將barcode帶到不同的腦區位置。以Virus-tracing 的方式，結合最終的測序來解析神經元之間的關係，建立腦內的神經環路，該方法有望用於神經疾病的相關研究。

　　報告結束後，曹罡教授針對在場學生及研究人員提出的不同問題，給出了詳細的回答。

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